Beschreibung
Die Synthese von 1′-Cyano‑2′-deoxynucleosiden mit einer Pyrimidin-Kernbase erfolgte unter Verwendung einer Deoxyribose,wodurch sowohl das α- als auch das β‑Anomer für biologische Tests zugänglich war. Von den 1′-Cyanonucleosiden ausgehend wurde an der Synthese von Phosphitamid-Bausteinen gearbeitet, die an der 1′-Position eine Aminomethylgruppe tragen.
An ein DNA-Octamer, dass das 1′-Aminomethylnucleotid im Inneren seiner Sequenz trug, wurden dann unter Mikrowellenstrahlung eine Reihe von Carbonsäuren gekuppelt und die Stabilität der resultierenden Duplexe bestimmt.
Das Polypeptid-Analogon (ßAla)5Py3Ac wurde auf fester Phase synthetisiert. Dieser Minor Groove Binder wurde auf ein Undecamer gekuppelt, das am 5′-Terminus einen 1′-Aminomethylrest trug. Ein UVSchmelzkurvenexperiment zeigte eine Erhöhung der Schmelztemperatur um 24.7°C. Dies legt den Schluss nahe, dass der Substituent (ßAla)5Py3Ac in der kleinen Furche eine Haarnadel-Struktur ausbildet und dadurch den Duplex stabilisiert.